Передача в тривалу оренду 14,5 га молдавської території Україні для повноцінного функціонування Дністровського комплексного гідровузла викликав масу негативних побоювань з боку екологів з приводу його негативного впливу на екосистему Дністра.Екологи з Міжнародної асоціації «Еко-Тірас» впевнені, що продовження будівництва гідроаккумуляціонной станції (ГАЕС) завдасть великої екологічної шкоди нижній течії Дністра (Молдова і Одеська область), а саме, порушить природний температурний гідрологічний режим, змінить мікроклімат, що призведе до втрати рікою функції самоочищення і рекреації.Екологи «Еко-Тірас» занепокоєні тим, що в новому договорі не враховуються екологічні складові, а тільки технічні і комерційні чинники.«Всі документи, які розробляються і стосуються Дністра, повинні мати комплексний характер, тобто пов’язувати не тільки економічні, а й екологічні складові», зазначив виконавчий директор міжнародної екологічної асоціації «Еко-Тірас» Ілля Тромбіцкій.За його словами, тільки комплексний підхід до угоди зможе забезпечити нормальний стан навколишнього середовища.
«Ми закликаємо уряд Молдови переглянути проект угоди і вийти на переговори з повноцінними пропозиціями, і, головне, зумовити підписання цього документа підписанням басейного угоди по Дністру, яке вже готове», підкреслив Тромбіцкій.На будівництво Дністровської ГАЕС в 2011 р. виділено 1,9 млрд. гривень.Кошти спрямовуються на виготовлення другого гідроагрегату, будівництво водосховища на 32 млн. кубічних метрів, а також на соціальну сферу Сокирянського району і м. Новодністровськ.Другий гідроагрегат планується ввести в експлуатацію в 2012 р., третій – в 2013 р.